औरंगाबाद आयुक्तालय का कार्यालय टाउन सेन्टर, एन-5, सिडको, औरंगाबाद स्थित सरकारी भवन में हैI औरंगाबाद आयुक्तालय, पुणे आयुक्तालय-II के क्षेत्राधिकार से सन् 1983 को अलग हो गया था लेकिन वास्तविक रूप में अपना कार्य 1984 से आरम्भ किया और तभी से इसका विकास होते हुए आज इसका कायापलट हो गया हैI आयुक्तालय का वर्ष 1983-84 में कुल केन्द्रीय उत्पाद शुल्क राजस्व रू. 180 करोड़ था जो कि वर्ष 2013-14 में बढ़कर रू. 1083.03 करोड़ हो गया हैI इसके अतिरिक्त आयुक्तालय का वर्ष 2013-14 का सेवाकर राजस्व रू. 471.25 करोड़ तथा सीमा शुल्क राजस्व रू. 341.34 करोड़ हैI

औरंगाबाद आयुक्तालय का जब गठन हुआ था तब इसमें महाराष्ट्र राज्य के औरंगाबाद, अहमदनगर, जालना, नांदेड़, बीड़, हिंगोली, परभणी, लातूर, उस्मानाबाद, सोलापुर, नासिक, धुले व जलगॉंव जिले शामिल थेI आगे सन् 1996 में सोलापुर जिला पृथक होकर आयुक्तालय पुणे-III में शामिल हो गयाI नासिक आयुक्तालय का गठन सन् 2002 में नासिक, धुले, जलगॉंव व नन्दुरवार जिलों को अलग कर किया गयाI

केन्द्रीय उत्पाद शुल्क एवं सीमा शुल्क बोर्ड के दिनांक 15 अक्टूबर 2014 से लागू पुनगर्ठन के तहत औरंगाबाद आयुक्ता‍लय के क्षेत्राधिकार पुनर्गठन में औरंगाबाद आयुक्तालय में नया मण्डल कार्यालय औरंगाबाद-IV मण्डल बनाया गया है, जिसमें जालना-I, जालना-II, पैठण-I, पैठण-II तथा चिकलथाना रेंज कार्यालय हैI

औरंगाबाद आयुक्तालय में सन् 1983 से निम्न लिखित आयुक्त पदस्थापित रहे :-